El programa de Postgraduación en Ciencias Farmacéuticas fue creado en 2005 y reconocido por el CNE en 2006 (Portaria N° 2.000 – DOU 21/12/06 – Parecer), con el objetivo de construir un espacio de excelencia para los estudios en el área de Ciencias Farmacéuticas, fomentando estrategias de investigación, capacitando recursos humanos para actuar en la región y establecer cooperación técnica – académica  con instituciones regionales, nacionales e internacionales apuntando al entendimiento del proceso salud por enfermedad y el aprovechamiento de la biodiversidad para mejorar la calidad de vida del amazonense.

El área de Concentración del PPGCF es “Fármacos y Medicamentos” y las líneas de investigación son: Evaluación Biológica de Principios Activos Naturales y Sintéticos. En estas dos líneas estructurales, el PPGCF propone orientar y esclarecer mecanismos fisiopatológicos de enfermedades prevalentes en la Amazónia, evaluar la actividad biológica de especies vegetales nativas, así como, realizar la caracterización química de especies vegetales nativas, desenvolver fitoterápicos y fitocosméticos, su control de calidad y evaluar sus formas de usos, además de emplear herramientas computacionales para proponer modificaciones químicas en moléculas derivadas de vegetales o sintéticas contribuyendo para el aprovechamiento racional de la biodiversidad amazónica.

De esta forma, el PPGCF apunta capacitar a los profesionales con el fin de alcanzar los siguientes objetivos específicos:

1. Formar recursos humanos altamente calificados para ejercer actividades docentes y de investigación en el área de fármacos y medicamentos a fin de atender las demandas relativas al aprovechamiento racional de los recursos naturales de la Amazónia, tornándose aptos en la formulación de estrategias de investigación en el área de Ciencias Farmacéuticas en la región, así como en otras regiones Brasileñas y otros países;

2. Aprovechar la biodiversidad amazónica con el propósito del desenvolvimiento tecnológico de medicamentos como alternativas terapéuticas;

3. Promover el diálogo continuo con los estudiantes de graduación, con visión a la formación de investigadores comprometidos con el desarrollo de las Ciencias Farmacéuticas en la región.

4. Integrar las diferentes actividades de investigación y educación generando una perspectiva innovadora de investigación de las Ciencias Farmacéuticas en la Amazónia que constituirá la base para la formación de nuevos pesquisidores;

5. Incentivar la formación de núcleos de producción de conocimientos en otros estados de la Amazónia e incentivar cooperaciones entre los Docentes del Programa e Instituciones internacionales, a partir de la articulación de grupos de investigación.

Desde el primer proceso selectivo, en agosto 2006, el PPGCF ya formo más de 160 magísteres en el área de ciencias farmacéuticas, con graduación en diversos cursos, como Farmacia, Odontología, Química, Enfermería, Fisioterapia, Ingeniería Química entre otros, oriundos de otros estados del Norte, Sur y Sudeste del País, inclusive de otros continentes, incluyendo África, que escogen la Amazónia para el desarrollo de sus investigaciones, indicando la importancia y el papel estratégico del Programa para la capacitación de recursos humanos de la región amazónica.

Actualmente, el Programa cuenta con 20 becas de la CAPES y 6 becas de CNPq. En 2018, el cuadro docente es compuesto por 20 docentes, de los cuales 14 son investigadores permanentes, 5 colaboradores y 1 investigador visitante. De estés, 13 son de la Facultad de Farmacia, 2 de la Facultad de Química, 1 de la Facultad de Ingeniería Química, 3 del Instituto de Ciencias Biológicas y 1 investigador visitante de la UFMG. En 2017, el cuadro docente permanente contaba con 5 becarios de productividad en Investigación y tres becarios en Desarrollo Tecnológico. Los docentes son especialistas en las diferentes líneas de investigación del área de Ciencias Farmacéuticas, con dedicaciones exclusivas y pertenecientes al cuadro de la UFPA, lo que permite los créditos obligatorios y complementarios necesarios para que la titulación sea obtenida en las diversas disciplinas administradas en el Programa. Excepcionalmente y de acuerdo con recomendaciones del orientador, los alumnos pueden cursar disciplinas en otros programas de pos-graduación. Todos los docentes poseen experiencia en orientación de Maestría y buena parte en Doctorado.